1911年宣教師宋雅各醫師提議遷址台北市,1912年12月26日醫院落成,教會派宋雅各醫師擔任首任院長,改名為馬偕紀念醫院,以紀念馬偕牧師。目前為台北地區的醫學中心,除台北總院外亦有淡水院區、新竹分院、台東分院。
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